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【技术】浅谈SDTMIG v3.4的IS域的更新—变化、原因和适用范围
2024-12-01 12:25

  一、SDTMIG v3.4中IS域的扩展范围和新定义

SDTMIG v3.4中当前的免疫原性样本评估域(IS)旨在表示与基于样本的评估有关的数据,这些数据衡量“抗原刺激或遭遇时免疫反应的存在、程度和规模”。新的域定义不仅更好地符合“免疫原性”的科学定义,而且还扩大了IS域的范围,使其与SDTMIG的先前版本(即v3.2和v3.3)中将IS域定义为表示与“描述治疗是否引发/引起/诱导免疫反应的评估”有关的数据不同。

更新的IS域中,“抗原”为能够诱导宿主免疫反应的任何实体,可以是(但不限于)药物/试验物质(研究/非研究疗法)、过敏原、微生物(如细菌、病毒、真菌、寄生虫等)、自身抗原等。

根据SDTMIG v3.4,“检测抗原刺激下免疫反应的存在,并量化其程度和规模”的评估应被纳入到IS域中,具体如下:

1.活化的免疫细胞,主要(但不限于)指通过ELISPOT技术测得的:

分泌细胞因子的细胞

抗体分泌细胞

2.活化的免疫细胞产物:抗体(即体液免疫反应)

抗药物抗体

用于微生物学和疫苗研究的抗微生物抗体

抗过敏原抗体,用于过敏研究

抗自身抗原抗体(也称为自身抗体),用于自身免疫性疾病研究

其他,如用于移植、输血研究的同种异体抗体

3.其他目前未分类的基于样本的免疫反应测试


  二、促使SDTMIG v3.4的IS域范围发生更新背后的原因

在SDTMIG v3.4发布之前,大多数基于样本的免疫原性评估数据都已映射到微生物学样本域(MB)和实验检查域(LB),但这些domain没有足够的结构和标准变量来支持这些数据的有意义表示。因此,必须创建各种补充限定符来映射LB和MB中的关键免疫原性测试信息。SDTMIG v3.4中的IS域有新的标准变量,用于稳定且一致地表示关键信息。

MB和LB域也采用组合的TEST/TESTCD值建模方法,但对于被评估的“分析物”缺乏明确的定义和界限,因此,太多的信息被协调到TEST/TESTCD值中,导致--TEST/--TESTCD变量过载。

此外,CDISC一致性规则规定,<=8个字符的TESTCD/PARAMCD和<=40个字符的TEST/PARAM值可用于向监管机构递交数据。由于8个字符和40个字符的限制,LB和MB TEST/TESTCD值被大量缩写,在某些情况下为了确保唯一性,TESTCD值被NCI C-codes替换,这大大削弱了它们的意义和清晰度,并进一步使TEST/TESTCD值的数据/字典管理变得困难。SDTMIG v3.4中更新的IS域还引入了几个新的变量限定符标准变量,以帮助解决--TEST/--TESTCD变量过载的问题。

由于SDTMIG版本的变化和IS域范围的限制,多个SDTM域曾经被用来表示一个共同主题的数据。

在SDTMIG v3.4中,“检测抗原刺激下免疫反应的存在,并量化其程度和规模”的基于样本的评估已经属于IS域的范围,然而在过去已被映射到各种基于样本的域,如LB、MB和 IS。

更具体地说:

研究治疗暴露后激活的免疫细胞已进入IS域

抗药物抗体应在IS域中建模

抗微生物抗体可以被映射到多个域

a.在研究治疗暴露前收集如果在SDTMIG v3.2或SENDIG v3.0和v3.1下提交数据,请使用LB域如果根据SDTMIG v3.3提交数据,请使用MB域b.在研究治疗暴露后收集时:使用IS域抗过敏原抗体可以被映射到多个域

a.如果是由于自然发生或之前接触的过敏原或治疗,请使用LB域b.如果在研究免疫疗法给药后进行测量(例如,对过敏疫苗的反应导致抗过敏原IgE抗体滴度增加/降低),则使用IS域根据SDTMIG v3.2/3.3,自身抗体和同种异体抗体仍被映射到LB域

在器官移植研究中,同种异体抗体也存在类似的不明确。如果器官接受者由于之前的暴露(例如输血、怀孕或之前的移植)而产生某些抗供体同种异体抗体,则这些数据属于LB域,如果同种异体抗体水平在接受器官移植后发生变化,则属于IS

以下是常见的ISTEST和对应的ISTESTCD值,供读者参考。

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 总结  

综上,CDISC原则规定域是基于主题,具有共同“主题”的记录应映射到一个域中(除非它们基于结构和CDISC指导原则)。SDTMIG v3.4中IS域范围更新背后的主要驱动力是,无论是以抗体还是免疫细胞激活的形式,对刺激后免疫反应的幅度和规模的测量都是对免疫原性的评估,因此应该映射到一个独立的域中,而不考虑刺激的来源(研究治疗、非研究治疗或抗原暴露)。这一论点与CDISC的基于主题的域的原则相一致,也避免了用户根据刺激来源和用于数据提交的SDTMIG版本将同类数据分为不同域。 


  参考文献  

[1]IS Domain Scope Update for the SDTMIG v3.4: A Development History and the Difficulties of Standardizing Complicated Biological Processes [J/OL]. https://www.cdisc.org/kb/articles/domain-scope-update-sdtmig-v3-4-development-history-and-difficulties-standardizing

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